Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms