Protein–RNA interactions for Protein: Q96AG4

LRRC59, Leucine-rich repeat-containing protein 59, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC59Q96AG4 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC59Q96AG4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC59Q96AG4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC59Q96AG4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC59Q96AG4 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC59Q96AG4 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC59Q96AG4 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC59Q96AG4 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC59Q96AG4 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC59Q96AG4 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC59Q96AG4 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC59Q96AG4 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC59Q96AG4 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC59Q96AG4 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC59Q96AG4 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC59Q96AG4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC59Q96AG4 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC59Q96AG4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC59Q96AG4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC59Q96AG4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC59Q96AG4 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC59Q96AG4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC59Q96AG4 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC59Q96AG4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC59Q96AG4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LRRC59Q96AG4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LRRC59Q96AG4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LRRC59Q96AG4 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC59Q96AG4 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC59Q96AG4 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC59Q96AG4 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC59Q96AG4 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC59Q96AG4 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC59Q96AG4 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC59Q96AG4 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC59Q96AG4 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC59Q96AG4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC59Q96AG4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC59Q96AG4 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC59Q96AG4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC59Q96AG4 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC59Q96AG4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC59Q96AG4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC59Q96AG4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC59Q96AG4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC59Q96AG4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC59Q96AG4 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC59Q96AG4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC59Q96AG4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC59Q96AG4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC59Q96AG4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC59Q96AG4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC59Q96AG4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC59Q96AG4 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC59Q96AG4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC59Q96AG4 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC59Q96AG4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC59Q96AG4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC59Q96AG4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC59Q96AG4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC59Q96AG4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC59Q96AG4 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC59Q96AG4 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC59Q96AG4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC59Q96AG4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC59Q96AG4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC59Q96AG4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC59Q96AG4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC59Q96AG4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC59Q96AG4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC59Q96AG4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC59Q96AG4 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC59Q96AG4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC59Q96AG4 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC59Q96AG4 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC59Q96AG4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC59Q96AG4 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC59Q96AG4 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC59Q96AG4 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC59Q96AG4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC59Q96AG4 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC59Q96AG4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC59Q96AG4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC59Q96AG4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC59Q96AG4 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC59Q96AG4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC59Q96AG4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC59Q96AG4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC59Q96AG4 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC59Q96AG4 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC59Q96AG4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC59Q96AG4 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC59Q96AG4 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC59Q96AG4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC59Q96AG4 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC59Q96AG4 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC59Q96AG4 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC59Q96AG4 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC59Q96AG4 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC59Q96AG4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms