Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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