Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HLA-CQ95604 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms