Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNPO1Q92973 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 206.5 ms