Protein–RNA interactions for Protein: Q92922

SMARCC1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCC1Q92922 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCC1Q92922 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCC1Q92922 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCC1Q92922 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCC1Q92922 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCC1Q92922 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCC1Q92922 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCC1Q92922 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCC1Q92922 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCC1Q92922 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCC1Q92922 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCC1Q92922 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCC1Q92922 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCC1Q92922 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCC1Q92922 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCC1Q92922 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCC1Q92922 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCC1Q92922 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCC1Q92922 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCC1Q92922 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SMARCC1Q92922 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SMARCC1Q92922 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCC1Q92922 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms