Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERCC4Q92889 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERCC4Q92889 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERCC4Q92889 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERCC4Q92889 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERCC4Q92889 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERCC4Q92889 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERCC4Q92889 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ERCC4Q92889 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms