Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ69

C11orf40, Putative uncharacterized protein C11orf40, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf40Q8WZ69 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C11orf40Q8WZ69 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
C11orf40Q8WZ69 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C11orf40Q8WZ69 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C11orf40Q8WZ69 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C11orf40Q8WZ69 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C11orf40Q8WZ69 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C11orf40Q8WZ69 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C11orf40Q8WZ69 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C11orf40Q8WZ69 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C11orf40Q8WZ69 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C11orf40Q8WZ69 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C11orf40Q8WZ69 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C11orf40Q8WZ69 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C11orf40Q8WZ69 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C11orf40Q8WZ69 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C11orf40Q8WZ69 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C11orf40Q8WZ69 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C11orf40Q8WZ69 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C11orf40Q8WZ69 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C11orf40Q8WZ69 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C11orf40Q8WZ69 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C11orf40Q8WZ69 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C11orf40Q8WZ69 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C11orf40Q8WZ69 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C11orf40Q8WZ69 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C11orf40Q8WZ69 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C11orf40Q8WZ69 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C11orf40Q8WZ69 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C11orf40Q8WZ69 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C11orf40Q8WZ69 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C11orf40Q8WZ69 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C11orf40Q8WZ69 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C11orf40Q8WZ69 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C11orf40Q8WZ69 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C11orf40Q8WZ69 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C11orf40Q8WZ69 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C11orf40Q8WZ69 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C11orf40Q8WZ69 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
C11orf40Q8WZ69 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C11orf40Q8WZ69 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
C11orf40Q8WZ69 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C11orf40Q8WZ69 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C11orf40Q8WZ69 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
C11orf40Q8WZ69 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C11orf40Q8WZ69 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C11orf40Q8WZ69 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
C11orf40Q8WZ69 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C11orf40Q8WZ69 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C11orf40Q8WZ69 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C11orf40Q8WZ69 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C11orf40Q8WZ69 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C11orf40Q8WZ69 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
C11orf40Q8WZ69 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
C11orf40Q8WZ69 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C11orf40Q8WZ69 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C11orf40Q8WZ69 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C11orf40Q8WZ69 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C11orf40Q8WZ69 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C11orf40Q8WZ69 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C11orf40Q8WZ69 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C11orf40Q8WZ69 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C11orf40Q8WZ69 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C11orf40Q8WZ69 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C11orf40Q8WZ69 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C11orf40Q8WZ69 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C11orf40Q8WZ69 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C11orf40Q8WZ69 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C11orf40Q8WZ69 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
C11orf40Q8WZ69 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C11orf40Q8WZ69 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
C11orf40Q8WZ69 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C11orf40Q8WZ69 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C11orf40Q8WZ69 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C11orf40Q8WZ69 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C11orf40Q8WZ69 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C11orf40Q8WZ69 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C11orf40Q8WZ69 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C11orf40Q8WZ69 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C11orf40Q8WZ69 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C11orf40Q8WZ69 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
C11orf40Q8WZ69 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C11orf40Q8WZ69 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C11orf40Q8WZ69 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C11orf40Q8WZ69 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C11orf40Q8WZ69 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
C11orf40Q8WZ69 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C11orf40Q8WZ69 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C11orf40Q8WZ69 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C11orf40Q8WZ69 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C11orf40Q8WZ69 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C11orf40Q8WZ69 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C11orf40Q8WZ69 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C11orf40Q8WZ69 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C11orf40Q8WZ69 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C11orf40Q8WZ69 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C11orf40Q8WZ69 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C11orf40Q8WZ69 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C11orf40Q8WZ69 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C11orf40Q8WZ69 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms