Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHW6

OTOS, Otospiralin, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOSQ8NHW6 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTOSQ8NHW6 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTOSQ8NHW6 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTOSQ8NHW6 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTOSQ8NHW6 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTOSQ8NHW6 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTOSQ8NHW6 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTOSQ8NHW6 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTOSQ8NHW6 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTOSQ8NHW6 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTOSQ8NHW6 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTOSQ8NHW6 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTOSQ8NHW6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTOSQ8NHW6 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTOSQ8NHW6 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTOSQ8NHW6 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTOSQ8NHW6 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTOSQ8NHW6 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTOSQ8NHW6 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTOSQ8NHW6 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTOSQ8NHW6 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTOSQ8NHW6 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTOSQ8NHW6 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTOSQ8NHW6 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTOSQ8NHW6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTOSQ8NHW6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTOSQ8NHW6 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTOSQ8NHW6 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTOSQ8NHW6 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
OTOSQ8NHW6 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTOSQ8NHW6 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTOSQ8NHW6 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTOSQ8NHW6 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTOSQ8NHW6 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTOSQ8NHW6 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTOSQ8NHW6 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTOSQ8NHW6 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTOSQ8NHW6 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTOSQ8NHW6 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTOSQ8NHW6 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTOSQ8NHW6 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTOSQ8NHW6 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTOSQ8NHW6 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
OTOSQ8NHW6 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
OTOSQ8NHW6 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTOSQ8NHW6 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTOSQ8NHW6 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTOSQ8NHW6 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTOSQ8NHW6 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTOSQ8NHW6 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTOSQ8NHW6 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTOSQ8NHW6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTOSQ8NHW6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTOSQ8NHW6 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTOSQ8NHW6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTOSQ8NHW6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTOSQ8NHW6 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
OTOSQ8NHW6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
OTOSQ8NHW6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTOSQ8NHW6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTOSQ8NHW6 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTOSQ8NHW6 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTOSQ8NHW6 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTOSQ8NHW6 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTOSQ8NHW6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTOSQ8NHW6 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTOSQ8NHW6 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTOSQ8NHW6 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTOSQ8NHW6 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTOSQ8NHW6 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTOSQ8NHW6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTOSQ8NHW6 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTOSQ8NHW6 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTOSQ8NHW6 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
OTOSQ8NHW6 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTOSQ8NHW6 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTOSQ8NHW6 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTOSQ8NHW6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
OTOSQ8NHW6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTOSQ8NHW6 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTOSQ8NHW6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTOSQ8NHW6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTOSQ8NHW6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
OTOSQ8NHW6 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTOSQ8NHW6 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTOSQ8NHW6 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
OTOSQ8NHW6 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTOSQ8NHW6 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTOSQ8NHW6 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTOSQ8NHW6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTOSQ8NHW6 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTOSQ8NHW6 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTOSQ8NHW6 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTOSQ8NHW6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTOSQ8NHW6 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTOSQ8NHW6 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTOSQ8NHW6 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTOSQ8NHW6 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTOSQ8NHW6 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
OTOSQ8NHW6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms