Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU8

LINC00116, Uncharacterized protein encoded by LINC00116, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00116Q8NCU8 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
LINC00116Q8NCU8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC00116Q8NCU8 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC00116Q8NCU8 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC00116Q8NCU8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC00116Q8NCU8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC00116Q8NCU8 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC00116Q8NCU8 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC00116Q8NCU8 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC00116Q8NCU8 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC00116Q8NCU8 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC00116Q8NCU8 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC00116Q8NCU8 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC00116Q8NCU8 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC00116Q8NCU8 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC00116Q8NCU8 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC00116Q8NCU8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC00116Q8NCU8 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC00116Q8NCU8 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC00116Q8NCU8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC00116Q8NCU8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC00116Q8NCU8 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00116Q8NCU8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00116Q8NCU8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00116Q8NCU8 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00116Q8NCU8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00116Q8NCU8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00116Q8NCU8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00116Q8NCU8 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00116Q8NCU8 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00116Q8NCU8 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00116Q8NCU8 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00116Q8NCU8 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00116Q8NCU8 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00116Q8NCU8 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00116Q8NCU8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00116Q8NCU8 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINC00116Q8NCU8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINC00116Q8NCU8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINC00116Q8NCU8 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINC00116Q8NCU8 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINC00116Q8NCU8 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINC00116Q8NCU8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINC00116Q8NCU8 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINC00116Q8NCU8 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINC00116Q8NCU8 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINC00116Q8NCU8 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINC00116Q8NCU8 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINC00116Q8NCU8 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINC00116Q8NCU8 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINC00116Q8NCU8 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LINC00116Q8NCU8 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINC00116Q8NCU8 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LINC00116Q8NCU8 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINC00116Q8NCU8 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINC00116Q8NCU8 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LINC00116Q8NCU8 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms