Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CNBD1Q8NA66 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms