Protein–RNA interactions for Protein: Q8N616

LINC00311, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00311, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00311Q8N616 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00311Q8N616 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00311Q8N616 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00311Q8N616 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00311Q8N616 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00311Q8N616 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00311Q8N616 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00311Q8N616 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00311Q8N616 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00311Q8N616 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00311Q8N616 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00311Q8N616 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00311Q8N616 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00311Q8N616 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00311Q8N616 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00311Q8N616 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00311Q8N616 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00311Q8N616 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00311Q8N616 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms