Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZQ1

WDFY3, WD repeat and FYVE domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDFY3Q8IZQ1 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDFY3Q8IZQ1 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
WDFY3Q8IZQ1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
WDFY3Q8IZQ1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
WDFY3Q8IZQ1 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
WDFY3Q8IZQ1 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
WDFY3Q8IZQ1 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
WDFY3Q8IZQ1 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
WDFY3Q8IZQ1 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
WDFY3Q8IZQ1 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
WDFY3Q8IZQ1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDFY3Q8IZQ1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDFY3Q8IZQ1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDFY3Q8IZQ1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDFY3Q8IZQ1 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms