Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC50Q8IVM0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC50Q8IVM0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC50Q8IVM0 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC50Q8IVM0 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC50Q8IVM0 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC50Q8IVM0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC50Q8IVM0 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC50Q8IVM0 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC50Q8IVM0 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC50Q8IVM0 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC50Q8IVM0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC50Q8IVM0 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC50Q8IVM0 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC50Q8IVM0 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC50Q8IVM0 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC50Q8IVM0 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC50Q8IVM0 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC50Q8IVM0 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC50Q8IVM0 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC50Q8IVM0 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC50Q8IVM0 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC50Q8IVM0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC50Q8IVM0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC50Q8IVM0 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC50Q8IVM0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC50Q8IVM0 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC50Q8IVM0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC50Q8IVM0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC50Q8IVM0 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC50Q8IVM0 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC50Q8IVM0 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC50Q8IVM0 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC50Q8IVM0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC50Q8IVM0 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC50Q8IVM0 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC50Q8IVM0 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC50Q8IVM0 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC50Q8IVM0 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC50Q8IVM0 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC50Q8IVM0 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC50Q8IVM0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC50Q8IVM0 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC50Q8IVM0 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC50Q8IVM0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC50Q8IVM0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC50Q8IVM0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC50Q8IVM0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC50Q8IVM0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC50Q8IVM0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC50Q8IVM0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC50Q8IVM0 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC50Q8IVM0 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC50Q8IVM0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC50Q8IVM0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC50Q8IVM0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC50Q8IVM0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC50Q8IVM0 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC50Q8IVM0 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC50Q8IVM0 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC50Q8IVM0 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC50Q8IVM0 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC50Q8IVM0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC50Q8IVM0 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC50Q8IVM0 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC50Q8IVM0 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC50Q8IVM0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms