Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNMB4Q86W47 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms