Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms