Protein–RNA interactions for Protein: Q76B58

BRINP3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP3Q76B58 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRINP3Q76B58 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRINP3Q76B58 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRINP3Q76B58 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
BRINP3Q76B58 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRINP3Q76B58 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRINP3Q76B58 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRINP3Q76B58 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRINP3Q76B58 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRINP3Q76B58 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
BRINP3Q76B58 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRINP3Q76B58 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRINP3Q76B58 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRINP3Q76B58 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRINP3Q76B58 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
BRINP3Q76B58 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
BRINP3Q76B58 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRINP3Q76B58 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRINP3Q76B58 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRINP3Q76B58 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRINP3Q76B58 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
BRINP3Q76B58 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
BRINP3Q76B58 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms