Protein–RNA interactions for Protein: Q709C8

VPS13C, Vacuolar protein sorting-associated protein 13C, humanhuman

Predictions only

Length 3,753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS13CQ709C8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS13CQ709C8 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS13CQ709C8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS13CQ709C8 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS13CQ709C8 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS13CQ709C8 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS13CQ709C8 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS13CQ709C8 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS13CQ709C8 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS13CQ709C8 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS13CQ709C8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms