Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAXIP1Q6ZW49 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms