Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms