Protein–RNA interactions for Protein: Q6QNY1

BLOC1S2, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLOC1S2Q6QNY1 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BLOC1S2Q6QNY1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BLOC1S2Q6QNY1 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BLOC1S2Q6QNY1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BLOC1S2Q6QNY1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms