Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUI1

CCDC144NL, Putative coiled-coil domain-containing protein 144 N-terminal-like, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144NLQ6NUI1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms