Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ19

CCSAP, Centriole, cilia and spindle-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAPQ6IQ19 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
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