Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0B7

TMEM236, Transmembrane protein 236, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM236Q5W0B7 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM236Q5W0B7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms