Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01545Q5VT33 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms