Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms