Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C10orf55Q5SWW7 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms