Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVL4

EFHC1, EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1Q5JVL4 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EFHC1Q5JVL4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms