Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms