Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms