Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DUSP28Q4G0W2 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms