Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LETM2Q2VYF4 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LETM2Q2VYF4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LETM2Q2VYF4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LETM2Q2VYF4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LETM2Q2VYF4 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LETM2Q2VYF4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LETM2Q2VYF4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LETM2Q2VYF4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LETM2Q2VYF4 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LETM2Q2VYF4 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LETM2Q2VYF4 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LETM2Q2VYF4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LETM2Q2VYF4 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LETM2Q2VYF4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LETM2Q2VYF4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LETM2Q2VYF4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LETM2Q2VYF4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LETM2Q2VYF4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LETM2Q2VYF4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LETM2Q2VYF4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LETM2Q2VYF4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LETM2Q2VYF4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LETM2Q2VYF4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LETM2Q2VYF4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LETM2Q2VYF4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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