Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL40Q2TBA0 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms