Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC57Q2TAC2 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC57Q2TAC2 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC57Q2TAC2 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC57Q2TAC2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC57Q2TAC2 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC57Q2TAC2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC57Q2TAC2 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC57Q2TAC2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC57Q2TAC2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC57Q2TAC2 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC57Q2TAC2 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC57Q2TAC2 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC57Q2TAC2 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC57Q2TAC2 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC57Q2TAC2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC57Q2TAC2 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC57Q2TAC2 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC57Q2TAC2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC57Q2TAC2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC57Q2TAC2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC57Q2TAC2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC57Q2TAC2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC57Q2TAC2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC57Q2TAC2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms