Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9J0

TYSND1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYSND1Q2T9J0 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TYSND1Q2T9J0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TYSND1Q2T9J0 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TYSND1Q2T9J0 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TYSND1Q2T9J0 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TYSND1Q2T9J0 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
TYSND1Q2T9J0 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TYSND1Q2T9J0 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TYSND1Q2T9J0 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TYSND1Q2T9J0 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TYSND1Q2T9J0 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TYSND1Q2T9J0 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TYSND1Q2T9J0 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TYSND1Q2T9J0 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TYSND1Q2T9J0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TYSND1Q2T9J0 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TYSND1Q2T9J0 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TYSND1Q2T9J0 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TYSND1Q2T9J0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TYSND1Q2T9J0 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TYSND1Q2T9J0 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TYSND1Q2T9J0 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TYSND1Q2T9J0 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TYSND1Q2T9J0 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TYSND1Q2T9J0 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms