Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2I5

KRT24, Keratin, type I cytoskeletal 24, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT24Q2M2I5 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT24Q2M2I5 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms