Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GEN1Q17RS7 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms