Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ME3Q16798 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ME3Q16798 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ME3Q16798 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ME3Q16798 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ME3Q16798 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ME3Q16798 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ME3Q16798 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ME3Q16798 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ME3Q16798 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ME3Q16798 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ME3Q16798 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ME3Q16798 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ME3Q16798 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ME3Q16798 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ME3Q16798 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ME3Q16798 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ME3Q16798 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ME3Q16798 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ME3Q16798 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ME3Q16798 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ME3Q16798 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ME3Q16798 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ME3Q16798 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ME3Q16798 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ME3Q16798 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ME3Q16798 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ME3Q16798 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ME3Q16798 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ME3Q16798 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ME3Q16798 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ME3Q16798 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ME3Q16798 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ME3Q16798 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ME3Q16798 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ME3Q16798 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ME3Q16798 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ME3Q16798 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ME3Q16798 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ME3Q16798 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ME3Q16798 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ME3Q16798 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ME3Q16798 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ME3Q16798 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ME3Q16798 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ME3Q16798 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ME3Q16798 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ME3Q16798 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ME3Q16798 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ME3Q16798 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ME3Q16798 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ME3Q16798 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ME3Q16798 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ME3Q16798 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ME3Q16798 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ME3Q16798 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ME3Q16798 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ME3Q16798 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ME3Q16798 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ME3Q16798 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ME3Q16798 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ME3Q16798 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ME3Q16798 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ME3Q16798 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ME3Q16798 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ME3Q16798 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ME3Q16798 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ME3Q16798 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ME3Q16798 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ME3Q16798 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ME3Q16798 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ME3Q16798 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ME3Q16798 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ME3Q16798 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ME3Q16798 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ME3Q16798 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ME3Q16798 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ME3Q16798 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ME3Q16798 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ME3Q16798 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ME3Q16798 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ME3Q16798 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ME3Q16798 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ME3Q16798 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ME3Q16798 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ME3Q16798 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ME3Q16798 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ME3Q16798 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ME3Q16798 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ME3Q16798 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ME3Q16798 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ME3Q16798 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ME3Q16798 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ME3Q16798 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ME3Q16798 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ME3Q16798 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ME3Q16798 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ME3Q16798 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ME3Q16798 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ME3Q16798 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
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