Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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