Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDK4Q16654 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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