Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPE65Q16518 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
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