Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIK5Q16478 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIK5Q16478 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIK5Q16478 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIK5Q16478 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIK5Q16478 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIK5Q16478 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIK5Q16478 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIK5Q16478 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIK5Q16478 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIK5Q16478 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIK5Q16478 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIK5Q16478 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIK5Q16478 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIK5Q16478 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIK5Q16478 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIK5Q16478 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK5Q16478 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK5Q16478 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK5Q16478 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK5Q16478 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK5Q16478 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK5Q16478 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK5Q16478 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK5Q16478 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK5Q16478 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK5Q16478 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK5Q16478 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK5Q16478 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK5Q16478 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK5Q16478 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK5Q16478 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK5Q16478 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK5Q16478 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK5Q16478 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK5Q16478 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK5Q16478 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIK5Q16478 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIK5Q16478 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIK5Q16478 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIK5Q16478 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIK5Q16478 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIK5Q16478 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIK5Q16478 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIK5Q16478 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIK5Q16478 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIK5Q16478 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIK5Q16478 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIK5Q16478 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIK5Q16478 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIK5Q16478 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIK5Q16478 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIK5Q16478 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIK5Q16478 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
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