Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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GRIK4Q16099 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
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GRIK4Q16099 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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GRIK4Q16099 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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GRIK4Q16099 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
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GRIK4Q16099 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK4Q16099 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms