Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms