Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms