Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDSNQ15517 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms