Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC10A1Q14973 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms