Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms