Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2H3Q13889 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms