Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LMAN2Q12907 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
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